İncelemeye alınan gerçek ya da tüzel kişilerin, nedenlerini şöyle sıralayabiliriz ; vergi dairesi dosyasının taranması, mali tabloların analiz yoluyla ölçülerek, sektör, mükellef ve konu bazında seçim yapılması, merkezi denetim elemanları tarafından yapılan karşıt incelemeler, devamlı zarar beyan edilmesi, ortakların cari hesabının şişkinliği gibi tanılarda kişiler incelemeye tabi tutulur. Mükellefin ilk olarak işletme defterlerini istenilmesi ve incelemelerde vergi kaçağının olup olmaması, fatura kesimlerinde eksikliğin olup olmaması, yasal olmayan durumları tek tek incelenir. Yasal olmayan bir durum ile karşılaşıldığında incelemede görevli müfettiş incelemeye tabi tutulan mükellefe ceza tarh eder.